Le puy de Mercœur se trouve sur la commune de Saint-Genès-Champanelle, au sud-ouest de Clermont-Ferrand, juste au nord des puys de Lassolas et de la Vache.
Il s'agit d'un volcan de type strombolien présentant un cratère simple, régulier et complètement fermé culminant à 1 249 mètres d'altitude.